Posteriormente, em 1844, foi eleito Bispo Diocesano de Mariana, Primaz da então Província de Minas, tendo que investir seus esforços como prelado reformador, pois encontrou a ampla diocese em situações de grandes problemas, sejam no campo religioso, sejam na área social, marcada por muita pobreza, ignorância e sofrimento.
Dom Antônio Ferreira Viçoso investiu suas atenções, sobretudo na reforma do clero, na educação e na atenção aos pobres, incluindo importante atuação em favor da abolição da escravatura, pois tudo fez para que os negros fossem tratados com dignidade e respeito. Podemos afirmar que Dom Viçoso foi um precursor da libertação dos escravos alcançada pela Lei Aurea.
Ele percorreu sua enorme diocese mineira durante seus 31 anos de episcopado, inclusive visitando Juiz de Fora algumas vezes. Cumpriu em sua existência o que foi dito a respeito de Jesus: “Ele passou a vida fazendo o bem” (At 10,37). Faleceu em Mariana, em 1875, com fama de santidade. O processo de canonização está adiantado, tendo sido declarado ‘Venerável’.
Juiz de Fora recebeu do bispo benefícios significativos, sendo um dos mais importantes a já referida instituição canônica da Irmandade de Nosso Senhor dos Passos, além da criação da Paróquia de Santo Antônio, que, pelas leis da época, deu origem ao município de Juiz de Fora. Com o Decreto de 1855, a Santa Casa passou a existir oficialmente como entidade religiosa sanitária, única na região, para alívio de tantos doentes. A Santa Casa e a Irmandade de Nosso Senhor dos Passos vêm cumprindo sua nobre missão durante estes 170 anos, como instituição católica em benefício de toda a população do município juiz-forano e de seus arredores.
Graças à generosidade e espírito religioso do casal Barão e Baronesa de Bertioga e à atuação daquele grande Bispo do século XIX, a instituição vem superando dificuldades na história, congregando esforços de tantos profissionais da saúde, além de enorme plêiade de colaboradores irmanados nos mesmos ideais de Dom Antônio Ferreira Viçoso, um dos mais importantes benfeitores de Juiz de Fora.
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