Convidado pelo presidente do Senado, Rodrigo Pacheco, para assumir o cargo de diretor-executivo da Instituição Fiscal Independente (IFI) – órgão vinculado ao Senado Federal, criado em 2016, com o objetivo de aumentar a transparência das contas públicas do país – o ex-deputado Marcus Pestana se desfiliou do PSDB, partido do qual é um dos fundadores. O motivo está longe de divergência com a legenda. A resolução que criou a IFI proíbe o exercício de outra atividade profissional ou filiação político-partidária. Pestana que há cerca de um mês divulgou uma carta aberta denunciando que o centro-democrático vinha sofrendo um esvaziamento, já comunicou a desfiliação ao presidente nacional do partido, Eduardo Leite, governador do Rio Grande do Sul.
Pestana estava ativamente envolvido nas articulações do PSDB de Juiz de Fora já com vistas às eleições do ano que vem. Garantiu, no entanto, que o partido estará em boas mãos com a nova Comissão Provisória, cujos nomes já foram definidos e se encontram em avaliação no Diretório Estadual, em Belo Horizonte.